2002 年 4 月，辽宁省委对学校党政领导班子进行了调整，院长李鸿鸣兼任学校党委书记。
        从 2000 年至 2005 年这一时期，学校教学和教育事业蓬勃发展，办学规模和办学空间不断扩大，办学条件不断改善、办学实力不断增强。五年间，在校生由 4341 人扩大到 12121 人。 2002 年 9 月，图书馆竣工并交付使用。 2003 年 8 月，大学生公寓（一期）交付使用。 2004 年 8 月，职业技术学院教学主楼竣工并投入使用。同年，我校参与投资与政府共建的黑石礁公园正式对外开放。 2005 年 9 月，校本部主教学楼竣工并投入使用。同年，大连市水产集团养殖公司和红旗镇渤海养殖公司顺利搬迁，其占地 86 亩已正式划归我校，凌水养殖公司占地 57 亩也划归我校。
 
        学校教学和科研成果显著。由我校承担的“鲍多倍体育种技术研究”项目和参加的“牡蛎三倍体养殖技术”项目被列入重大产业化项目。有两项科技成果分别获得“国家技术发明二等奖”、和“辽宁省科技进步一等奖”。有一项教学研究成果被评为国家级优秀教学成果二等奖。我校水生生物实验室被评为辽宁省高校重点实验室。

        学校管理体制和教学改革不断深化，缩减了机构，实行全员聘任上岗，每三年进行一次；以学科建设为龙头，加强专业建设，从 2000 年到 2005 年期间，学校新增 14 个硕士点， 22 个本科专业，形成了以水产学科为优势学科，以生物、食品和环境工程为特色学科，以涉海学科为新兴学科的学科群。教学机构不断调整和完善，学校现有 11 个二级学院、两个部；设有商务信息学院（三本）、职业技术学院和成人教育学院，设有 6 个研究所。 2002 年，学校确立了创建海洋大学的奋斗目标，全校师生在这面旗帜的指引下，奋发图强，攻破前进道路上的重重困难，朝着创建海洋大学的目标努力奋斗。